Mail Commander dispose de fonctions avancées de filtre contre les spams, detruisant de manière automatique tous les messages non sollicités. Le logiciel est capable de filtrer et de détruire les messages non désirés directement depuis le serveur, avant qu'ils ne soient téléchargés sur le poste en local. Mail Commander dispose également de la capacité de personnaliser la distribution de mail à de nombreux destinataires. Avec ce logiciel vous serez en mesure d'envoyer des informations à un large groupe d'utilisateurs tout aussi aisément que s'il s'agissait d'un individu unique. Mail Commander peut conserver les informations de plusieurs comptes mails. Ainsi, si vous disposez des plusieurs boîtes aux lettres externes chez différents fournisseurs d'accès, il vous sera inutile de tout reconfigurer.